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Grundriss der Bioinformatik

Anwendungen in den Biowissenschaften und der Medizin
Verfasser*in: Suche nach Verfasser*in Rashidi, Hooman H.; Bühler, Lukas K.
Verfasser*innenangabe: Hooman H. Rashidi ; Lukas K. Bühler. Aus dem Engl. übers. von Olaf Werner
Jahr: 2001
Verlag: Heidelberg [u.a.], Spektrum, Akad. Verl.
Mediengruppe: Buch
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Inhalt

Die amerikanische Originalausgabe dieses Buches hat sich auf dem Markt sehr gut durchgesetzt, nicht zuletzt daran erkennbar, dass die deutsche Ausgabe innerhalb eines Jahres nach der Originalausgabe nun erscheint. Wie bereits im Vorwort zur englischen Ausgabe erwähnt, hat es der schnelle Fortschritt in Genomsequenzierung und Datenbankentwicklung erfordert, Zahlen, Internetadressen und Datenbankinhalte zu aktualisieren. Die bedeutendsten Entwicklungen haben auf dem Gebiet der Vervollständigung der Genomsequenzen höherer Organismen stattgefunden: der Nematode, ((i))C. elegans((/i)), die Fruchtfliege, ((i))Drosophila melanogaster((/i)), und ((i))Homo sapiens((/i)), das Humangenomprojekt mit 90% sequenziert, davon 75% immer noch im Entwurfstadium. Weniger publiziert, aber wahrscheinlich von größerer Bedeutung sind die Fortschritte in der Agrar-genomik, ein hauptsächlich von der Industrie betriebener Zweig der Biowissenschaften. Die geneti-sche Modifizierung von Reis zur Erhöhung der Konzentration des in vielen wirtschaftlich unterent-wickelten Ländern Afrikas und Asiens so notwendigen Vitamins A legt nicht nur Zeugnis ab von dem starken Einfluss, den die Biotechnologie auf das Genetic Engineering hat, sondern verkörpert zudem die Art von technologischem Fortschritt, der aus den Anwendungen der Bioinformatik in den Biowissenschaften resultiert. Gesundheit und Ernährung werden in den nächsten zehn Jahren den wirtschaftlichen Antrieb für Fortschritte in der Bioinformatik liefern, der theoretische Zweig der neuen Gebiete der Biologie: Genomik und Proteomik.
 
 
 
 
 
 
/ AUS DEM INHALT: / / /
 
 
Geleitwort
 
Vorwort
 
Vorwort zur deutschen Ausgabe
 
Danksagung
 
Die Autoren
 
 
 
Kapitel 1 Einführung in die Bioinformatik 1
 
1.1 Biologie und Bioinformatik 1
 
Die Merkmale öffentlich geförderter Forschung 3
 
Genomik und Proteomik 4
 
Stoffwechseldatenbanken 6
 
Öffentliche und private Bioinformatik 7
 
1.2 Computer in Biologie und Medizin 9
 
Computeralgorithmen 10
 
Unterschiedliche Computertypen für unterschiedliche Aufgaben 11
 
Supercomputer 11
 
Die Grenzen der Computeranalyse: Das paradoxe Versprechen des Internets 13
 
Die Notwendigkeit von Computerwerkzeugen 14
 
Neue Forschungsansätze mit Computern 15
 
1.3 Biologische Makromoleküle 16
 
Proteine 16
 
DNA- und RNA-Struktur 26
 
 
 
Kapitel 2 Datenbanken und Suchmaschinen
 
2.1 Computerwerkzeuge und Datenbanken
 
Das National Center for Biotechnology Information (NCBI)
 
Das European Bioinformatics Institute (EBI)
 
GenomeNet - japanische Bioinformatik-Server
 
2.2 Werkzeuge zur Prospektion der Datenbanken
 
Werkzeuge zur Suche ähnlicher Sequenzen
 
Werkzeuge zur Mustererkennung und Datenbanken
 
 
 
Kapitel 3 Genomanalyse
 
3.1 DNA-Klonierung und PCR
 
DNA-Klonierung
 
Erstellen eines Transkriptionsprofils
 
Positionelle Klonierung
 
Die Polymerasekettenreaktion (PCR): Reinigung und Amplifikation
 
Sequenzierungstechnologien im Entwicklungsstadium
 
Den Sequenzierungsfortschritt verfolgen
 
3.2 Computerwerkzeuge zur DNA-Sequenzanalyse
 
Datenbank-Einreichungen
 
Datenabfragen
 
Sequenz-alignment
 
Was die Sequenz über die biologische Funktion eines Gens verrät
 
Wie man ein Gen identifiziert: ORFs und URFs
 
Ein Wort zur Redundanz
 
Bessere Suchmaschinen für bessere Computer?
 
3.3 Genomanalyse
 
Genomorganisation
 
Die Kartjerung des Genoms
 
Der Fortschritt bei der Kartierung des menschlichen Genoms
 
3.4 Funktionelle Genomik
 
Nichtidentifizierte Leseraster: URFs
 
Cluster orthologer Gruppen: COGs
 
 
 
Kapitel 4 Proteomanalyse
 
4.1 Proteomforschung
 
2-D-PAGE bei Expasy
 
Spezialisierte 2-D-PAGE-Datenbanken
 
4.2 Die Rekonstruktion des Stoffwechsels
 
Die Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes: KEGG
 
Das Modell der funktionellen Rekonstruktion
 
Die £.-co//-Stoffwechseldatenbank: EcoCyc
 
Wohin weist die Entwicklung?
 
 
 
Kapitel 5 Die Computerrevolution in der Neurobiologie 135
 
5.1 Das Human Brain Project 135
 
Der Einfluss von Computern auf die Wissenschaft 135
 
Computer in der Neurobiologie und die Kartierung des menschlichen Gehirns 137
 
Von Molekülen zu neurodegenerativen Krankheiten 141
 
5.2 Computersimulationen und die Visualisierung molekularer Strukturen 145
 
3-D-Visualisierung 146
 
5.3 Vorhersagende Biologie 150
 
Vorhersage der Proteinstruktur 151
 
Software zur Strukturvorhersage 157
 
Glossar
 
Index
 

Details

Verfasser*in: Suche nach Verfasser*in Rashidi, Hooman H.; Bühler, Lukas K.
Verfasser*innenangabe: Hooman H. Rashidi ; Lukas K. Bühler. Aus dem Engl. übers. von Olaf Werner
Jahr: 2001
Verlag: Heidelberg [u.a.], Spektrum, Akad. Verl.
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Systematik: Suche nach dieser Systematik NN.BG
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ISBN: 3-8274-1094-0
Beschreibung: VI, 172 S. : Ill., graph. Darst.
Schlagwörter: Bioinformatik
Beteiligte Personen: Suche nach dieser Beteiligten Person Werner, Olaf
Originaltitel: Bioinformatics basics <dt.>
Fußnote: Literaturangaben
Mediengruppe: Buch