Jana, Tascha, Philipp, Fiete und Vivi sind fünf Freunde, die in ihrer Freizeit begeistert mal mehr, mal weniger schwierige Kriminalfälle in Hamburgs berühmter Speicherstadt lösen. Hierbei nehmen sie vor allem auch das Internet zu Hilfe. Ihr "Hauptquartier" ist das Gewürzlager von Overbeck & Consorten, daher ihr Name "Die Pfefferkörner". Zur Mitte der dritten Staffel nehmen alle außer Vivi Abschied von Hamburg, und das einzig verbliebene "Pfefferkorn" findet mit Paul, Panda, Katja und Jojo neue Freunde. Während der vierten Staffel wurden die jugendlichen Darsteller diesmal komplett ausgetauscht und durch fünf neue Freunde ersetzt.