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Vorbestellen	Zweigstelle: 07., Urban-Loritz-Pl. 2a	Standorte: NN.BG Hütt / College 6a - Naturwissenschaften	Status: Verfügbar	Frist:	Vorbestellungen: 0
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Verlagstext:

 

Schritt für Schritt zu den Konzepten. Die Autoren führen den Leser von den mathematischen Grundlagen zu den konkreten Methoden der Bioinformatik.

Das Buch wendet sich damit an alle, die bioinformatische Methoden und Softwarepakete verwenden wollen, sie aber nicht als Black Boxes akzeptieren möchten. Ein besonderes Highlight ist die schrittweise Implementierung wichtiger Algorithmen der Bioinformatik im Computeralgebra-Programm Mathematica, um die Konzepte auch auf der informatischen Ebene zu verstehen.

Das Themenspektrum reicht von bioinformatischen Alltagsfragen bis in die Systembiologie. Die zweite, stark erweiterte Auflage geht auch auf eine Reihe sehr aktueller Themen der Bioinformatik ein, etwa Next-Generation Sequencing (NGS), GWAS-Daten und Protein-Interaktions-Netzwerke.Der Inhalt ist spannend und leicht verständlich.

 

 

 

Aus dem Inhalt:

1 Skizze des Fachs 1 // 1.1 Zum Begriff Bioinformatik 2 // 1.2 Ideengeschichte der Genomanalyse 10 // 1.3 Einige biologische Grundbegriffe 15 // 1.4 Kernfragen der Bioinformatik 26 // 1.5 Einführung in das Computeralgebra-Programm Mathematica 32 // Quellen und weiterführende Literatur 40 // 2 Statistische Analyse von DNA-Sequenzen 43 // 2.1 Grundidee 43 // 2.2 Wahrscheinlichkeitsmodelle 44 // 2.3 BedingteWahrscheinlichkeiten 51 // 2.4 Parameterschätzung 57 // 2.5 Diskrete und stetige Verteilungen 65 // 2.6 Nullhypothesen und Eigenschaften realer Sequenzen 92 // 2.7 Markov-Modelle 96 // 2.7.1 Formale Definition von Markov-Ketten 96 // 2.7.2 Anwendungsbeispiel 100 // 2.8 Hidden-Markov-Modelle 105 // 2.8.1 Parameter von Hidden-Markov-Modellen 105 // 2.8.2 Viterbi-Decodierung 111 // 2.8.3 Posterior-Decodierung 124 // 2.8.4 Fortgeschrittene Themen und allgemeine Bemerkungen zu // Markov-Modellen 133 // 2.9 Anwendung von Hidden-Markov-Modellen 139 // 2.9.1 CpG-Inseln 139 // 2.9.2 Genidentifikation 147 // 2.9.3 Membranproteine 154 // Quellen und weiterführende Literatur 160 // 3 Praktische Bioinformatik 163 // 3.1 Grundlagen des Sequenzalignments 163 // 3.1.1 Scoring-Modelle und Dotplot-Visualisierungen 163 // 3.1.2 Algorithmen für paarweises Alignment 172 // 3.1.3 Implementierungen und weitere Beispiele 181 // 3.2 Weitere Aspekte des Sequenzalignments 200 // 3.2.1 Heuristische Methoden des Sequenzvergleichs 200 // 3.2.2 Multiples Alignment 206 // 3.2.3 Alignment-Scores 215 // 3.3 Phylogenetische Analysen 218 // 3.3.1 Grundidee phylogenetischer Analysen 218 // 3.3.2 Phylogenetische Bäume 219 // 3.3.3 Der UPGMA-Algorithmus 225 // 3.3.4 Der Neighbor-Joining-Algorithmus 230 // 3.3.5 Baumbewertung 236 // 3.3.6 Implementierung 239 // 3.4 Datenbanken und Annotation 242 // Quellen und weiterführende Literatur 248 // 4 Informationstheorie und statistische Eigenschaften von Genomen 251 // 4.1 Grundlagen der Informationstheorie 252 // 4.1.1 Entropie 252 // 4.1.2 Transinformation 258 // 4.1.3 Allgemeine Markov-Prozesse und der DAR(p)-Algorithmus 262 // 4.2 Genomeigenschaften und Korrelationen in DNA-Sequenzen 270 // 4.2.1 Globale statistische Eigenschaften eines Genoms 270 // 4.2.2 Korrelationen in DNA-Sequenzen 272 // Quellen und weiterführende Literatur 287 // 5 Neue Entwicklungen und angrenzende Themenfelder 289 // 5.1 DNA-Sequenzen und fraktale Geometrie 289 // 5.2 Netzwerke 315 // 5.3 Mathematische Modellierung und Systembiologie 357 // 5.3.1 Zielsetzung der Systembiologie 357 // 5.3.2 Prinzipien der mathematischen Modellierung biologischer // Systeme 359 // 5.3.3 Beispiele systembiologischer Analysen 372 // 5.3.4 Von der Systembiologie zur Systemmedizin 398 // Quellen und weiterführende Literatur 400 // Sachverzeichnis 403