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Angewandte Bioinformatik

eine Einführung
Verfasser*in: Suche nach Verfasser*in Selzer, P. M.; Marhöfer, Richard J.; Koch, Oliver
Verfasser*innenangabe: Paul M. Selzer, Richard J. Marhöfer, Oliver Koch
Jahr: 2018
Verlag: Berlin, Springer Spektrum
Reihe: Lehrbuch
Mediengruppe: Buch
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Inhalt

Für Studierende und Wissenschaftler der Lebenswissenschaften schafft dieses Buch einen schnellen, strukturierten Zugang zur Angewandten Bioinformatik ohne Programmierkenntnisse oder tiefgehende Informatikkenntnisse vorauszusetzen. Es bietet eine Einführung in die tägliche Anwendung der vielfältigen bioinformatischen Werkzeuge und gibt einen ersten Überblick über das sehr komplexe Fachgebiet. Die Kontrolle des vermittelten Stoffs wird durch Übungsbeispiele mit Lösungen gewährleistet. Ein Glossar der zugrundeliegenden Fachtermini sowie ein ausführliches Sachverzeichnis runden das Buch ab. Für die 2. Auflage wurde das Werk umfassend aktualisiert.
 
 
 
 
Aus dem Inhalt:
1 Die biologischen G rundlagen der Bioinformatik i / Paul M. Seher, Richard J. Marhöfer und Oliver Koch / 1.1 Nukleinsäuren und Proteine 2 / 12 Aufbau der Nukleinsäuren DNA und RNA 2 / 1.3 Die Speicherung der genetischen Information 5 / 1.4 Aufbau der Proteine 7 / 1.4.1 Primärstruktur 7 / 1.4.2 Sekundärstruktur 9 / 1.4.3 Tertiär- und Quartärstruktur 11 / 1.5 Übungen 12 / Literatur 12 // 2 Biologische Datenbanken 15 / Paul M. Seher, Richard J. Marhöfer und Oliver Koch / 2.1 Biologisches Wissen wird in globalen Datenbanken gespeichert 16 / 22 Primäre Datenbanken 17 / 22.1 Nukleotidsequenzdatenbanken 17 / 222 Proteinsequenzdatenbanken 22 / 2.3 Sekundäre Datenbanken 26 / 2.3.1 PROSITE 26 / 2.32 PRINTS 27 / 2.3.3 Pfam 28 / 2.3.4 Interpro 28 / 2.4 Genotyp-Phänotyp-Datenbanken 28 / 2.4.1 PhenomicDB 29 / 2.5 Molekülstruktur-Datenbanken 30 / 2.5.1 Protein Data Bank 30 / 2.52 Datenbank Structural Classification of Proteins 2 32 / 2.5.3 CATH 32 / 2.5.4 PubChem 33 / 2.6 Übungen 34 / Literatur 35 // 3 Sequenzvergleiche und sequenzbasierte D atenbank suchen 37 / Paul M. Seher, Richard /. Marhöfer und Oliver Koch / 3.1 Paarweise und multiple Sequenzvergleiche 38 / 3.2 Datenbanksuchen mit Nukleotid- und Proteinsequenzen 44 / 32.1 Wichtige Algorithmen zur Datenbanksuche 47 / 3.3 Software zur Sequenzanalyse 48 / 3.4 Übungen 50 / Literatur 51 // 4 Die Entschlüsselung eukaryotischer Genome 53 / Paul M. Seher, Richard J. Marhöfer und Oliver Koch / 4.1 Die Sequenzierung kompletter G enom e 54 / 42 Die Charakterisierung von Genomen mit STS- und EST-Sequenzen 54 / 4.2.1 Sequence Tagged Sites sind Orientierungspunkte im menschlichen Genom 54 / 4.22 Expressed Sequence Tags 55 / 4.3 Durchführung eines EST-Projekts 57 / 4.4 Die Identifizierung unbekannter Gene 59 / 4.5 Die Entdeckung von Spleißvarianten 62 / 4.6 Genetische Ursachen für individuelle Unterschiede 63 / 4.6.1 Pharmakogenetik 65 / 4.62 Personalisierte Medizin und Biomarker 69 / 4.6.3 Next Generation Sequencing 70 / 4.6.4 Proteogenomik 72 / 4.7 Übungen 73 / Literatur 74 // 5 Proteinstrukturen und Proteinstruktur-basiertes rationales Wirkstoffdesign 77 / Paul M. Seher, Richard J. Marhöfer und Oliver Koch / 5.1 Proteinaufbau 78 / 52 Signalpeptide 78 / 5.3 Transmembranproteine 81 / 5.4 Proteinstrukturanalysen 82 / 5.4.1 Proteinmodellierung 82 / 5.42 Die Bestimmung von Proteinstrukturen im Hochdurchsatzverfahren 83 / 5.5 Proteinstrukturbasiertes rationales Wirkstoffdesign 84 / 5.5.1 Ein Docking-Beispiel mit DOCK 85 / 5.52 Ein Docking-Beispiel mit GOLD 86 / 5.5.3 Pharmakophor-Modelle und Suchen 89 / 5.5.4 Erfolge des strukturbasierten rationalen Wirkstoffdesigns 90 / 5.6 Übungen 91 / Literatur 92 // 6 Die funktionelle Analyse von Genomen 95 / Paul M. Seher, Richard /. Marhöfer und Oliver Koch / 6.1 Die Identifizierung der zellulären Funktionen von Genprodukten 96 / 6.1.1 Transkriptomik 97 / 6.12 Proteomik 106 / 6.1.3 Metabolomik 115 / 6.1.4 Phenomics 117 / 62 Systembiologie 120 / 6.3 Übungen 123 / Literatur 125 // 7 Vergleichende Genomanalysen 127 / Paul M. Setzer, Richard /. Marhöfer und Oliver Koch / 7.1 Das Zeitalter der Genomsequenzierung 128 / 72 Wirkstoffforschung am Zielprotein 128 / 7.3 Vergleichende Genomanalysen geben Aufschluss über die Biologie von Organismen 130 / 7.3.1 Die Genomstruktur 130 / 7.3.2 Codierende Regionen 132 / 7.3.3 Nicht codierende Regionen 132 / 7.4 Vergleichende Stoffwechselanalysen 133 / 7.4.1 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes 137 / 7.5 Gruppen orthologer Proteine 139 / 7.6 Übungen 142 / Literatur 143 // Serviceteil 145 / Lösungen zu den Übungen 146 / Glossar 167 / Sachverzeichnis 181

Details

Verfasser*in: Suche nach Verfasser*in Selzer, P. M.; Marhöfer, Richard J.; Koch, Oliver
Verfasser*innenangabe: Paul M. Selzer, Richard J. Marhöfer, Oliver Koch
Jahr: 2018
Verlag: Berlin, Springer Spektrum
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Systematik: Suche nach dieser Systematik NN.BG
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ISBN: 978-3-662-54134-0
2. ISBN: 3-662-54134-3
Beschreibung: 2., überarb. und aktual. Auflage, XVII, 184 Seiten : Illustrationen, Diagramme
Reihe: Lehrbuch
Schlagwörter: Aufgabensammlung, Bioinformatik, Examensfragen, Gegenstandskatalog, Lösungssammlung, Übungsaufgaben, Übungsbuch
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Sprache: Deutsch
Mediengruppe: Buch