Die amerikanische Originalausgabe dieses Buches hat sich auf dem Markt sehr gut durchgesetzt, nicht zuletzt daran erkennbar, dass die deutsche Ausgabe innerhalb eines Jahres nach der Originalausgabe nun erscheint. Wie bereits im Vorwort zur englischen Ausgabe erwähnt, hat es der schnelle Fortschritt in Genomsequenzierung und Datenbankentwicklung erfordert, Zahlen, Internetadressen und Datenbankinhalte zu aktualisieren. Die bedeutendsten Entwicklungen haben auf dem Gebiet der Vervollständigung der Genomsequenzen höherer Organismen stattgefunden: der Nematode, ((i))C. elegans((/i)), die Fruchtfliege, ((i))Drosophila melanogaster((/i)), und ((i))Homo sapiens((/i)), das Humangenomprojekt mit 90% sequenziert, davon 75% immer noch im Entwurfstadium. Weniger publiziert, aber wahrscheinlich von größerer Bedeutung sind die Fortschritte in der Agrar-genomik, ein hauptsächlich von der Industrie betriebener Zweig der Biowissenschaften. Die geneti-sche Modifizierung von Reis zur Erhöhung der Konzentration des in vielen wirtschaftlich unterent-wickelten Ländern Afrikas und Asiens so notwendigen Vitamins A legt nicht nur Zeugnis ab von dem starken Einfluss, den die Biotechnologie auf das Genetic Engineering hat, sondern verkörpert zudem die Art von technologischem Fortschritt, der aus den Anwendungen der Bioinformatik in den Biowissenschaften resultiert. Gesundheit und Ernährung werden in den nächsten zehn Jahren den wirtschaftlichen Antrieb für Fortschritte in der Bioinformatik liefern, der theoretische Zweig der neuen Gebiete der Biologie: Genomik und Proteomik.
/ AUS DEM INHALT: / / /
Geleitwort
Vorwort
Vorwort zur deutschen Ausgabe
Danksagung
Die Autoren
Kapitel 1 Einführung in die Bioinformatik 1
1.1 Biologie und Bioinformatik 1
Die Merkmale öffentlich geförderter Forschung 3
Genomik und Proteomik 4
Stoffwechseldatenbanken 6
Öffentliche und private Bioinformatik 7
1.2 Computer in Biologie und Medizin 9
Computeralgorithmen 10
Unterschiedliche Computertypen für unterschiedliche Aufgaben 11
Supercomputer 11
Die Grenzen der Computeranalyse: Das paradoxe Versprechen des Internets 13
Die Notwendigkeit von Computerwerkzeugen 14
Neue Forschungsansätze mit Computern 15
1.3 Biologische Makromoleküle 16
Proteine 16
DNA- und RNA-Struktur 26
Kapitel 2 Datenbanken und Suchmaschinen
2.1 Computerwerkzeuge und Datenbanken
Das National Center for Biotechnology Information (NCBI)
Das European Bioinformatics Institute (EBI)
GenomeNet - japanische Bioinformatik-Server
2.2 Werkzeuge zur Prospektion der Datenbanken
Werkzeuge zur Suche ähnlicher Sequenzen
Werkzeuge zur Mustererkennung und Datenbanken
Kapitel 3 Genomanalyse
3.1 DNA-Klonierung und PCR
DNA-Klonierung
Erstellen eines Transkriptionsprofils
Positionelle Klonierung
Die Polymerasekettenreaktion (PCR): Reinigung und Amplifikation
Sequenzierungstechnologien im Entwicklungsstadium
Den Sequenzierungsfortschritt verfolgen
3.2 Computerwerkzeuge zur DNA-Sequenzanalyse
Datenbank-Einreichungen
Datenabfragen
Sequenz-alignment
Was die Sequenz über die biologische Funktion eines Gens verrät
Wie man ein Gen identifiziert: ORFs und URFs
Ein Wort zur Redundanz
Bessere Suchmaschinen für bessere Computer?
3.3 Genomanalyse
Genomorganisation
Die Kartjerung des Genoms
Der Fortschritt bei der Kartierung des menschlichen Genoms
3.4 Funktionelle Genomik
Nichtidentifizierte Leseraster: URFs
Cluster orthologer Gruppen: COGs
Kapitel 4 Proteomanalyse
4.1 Proteomforschung
2-D-PAGE bei Expasy
Spezialisierte 2-D-PAGE-Datenbanken
4.2 Die Rekonstruktion des Stoffwechsels
Die Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes: KEGG
Das Modell der funktionellen Rekonstruktion
Die £.-co//-Stoffwechseldatenbank: EcoCyc
Wohin weist die Entwicklung?
Kapitel 5 Die Computerrevolution in der Neurobiologie 135
5.1 Das Human Brain Project 135
Der Einfluss von Computern auf die Wissenschaft 135
Computer in der Neurobiologie und die Kartierung des menschlichen Gehirns 137
Von Molekülen zu neurodegenerativen Krankheiten 141
5.2 Computersimulationen und die Visualisierung molekularer Strukturen 145
3-D-Visualisierung 146
5.3 Vorhersagende Biologie 150
Vorhersage der Proteinstruktur 151
Software zur Strukturvorhersage 157
Glossar
Index
Verfasser*innenangabe:
Hooman H. Rashidi ; Lukas K. Bühler. Aus dem Engl. übers. von Olaf Werner
Jahr:
2001
Verlag:
Heidelberg [u.a.], Spektrum, Akad. Verl.
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Inhaltsverzeichnis
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Systematik:
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ISBN:
3-8274-1094-0
Beschreibung:
VI, 172 S. : Ill., graph. Darst.
Beteiligte Personen:
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Werner, Olaf
Originaltitel:
Bioinformatics basics <dt.>
Fußnote:
Literaturangaben
Mediengruppe:
Buch